Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Kcnip1Q9JJ57 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms