Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2ird1Q9JI57 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2ird1Q9JI57 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2ird1Q9JI57 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2ird1Q9JI57 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2ird1Q9JI57 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2ird1Q9JI57 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2ird1Q9JI57 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2ird1Q9JI57 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2ird1Q9JI57 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2ird1Q9JI57 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2ird1Q9JI57 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2ird1Q9JI57 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2ird1Q9JI57 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2ird1Q9JI57 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2ird1Q9JI57 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2ird1Q9JI57 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2ird1Q9JI57 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2ird1Q9JI57 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2ird1Q9JI57 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2ird1Q9JI57 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2ird1Q9JI57 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2ird1Q9JI57 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms