Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH9

Copz2, Coatomer subunit zeta-2, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz2Q9JHH9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Copz2Q9JHH9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms