Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OtofQ9ESF1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OtofQ9ESF1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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