Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES46

Parvb, Beta-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvbQ9ES46 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParvbQ9ES46 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParvbQ9ES46 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms