Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms