Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cxcr6Q9EQ16 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cxcr6Q9EQ16 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cxcr6Q9EQ16 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cxcr6Q9EQ16 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cxcr6Q9EQ16 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cxcr6Q9EQ16 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cxcr6Q9EQ16 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cxcr6Q9EQ16 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cxcr6Q9EQ16 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr6Q9EQ16 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr6Q9EQ16 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr6Q9EQ16 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr6Q9EQ16 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr6Q9EQ16 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr6Q9EQ16 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr6Q9EQ16 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr6Q9EQ16 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr6Q9EQ16 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr6Q9EQ16 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr6Q9EQ16 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr6Q9EQ16 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr6Q9EQ16 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr6Q9EQ16 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cxcr6Q9EQ16 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms