Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms