Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SyncQ9EPM5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SyncQ9EPM5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms