Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP97

Senp3, Sentrin-specific protease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp3Q9EP97 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Gm43149-201ENSMUST00000198162 1422 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Senp3Q9EP97 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Senp3Q9EP97 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Senp3Q9EP97 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Senp3Q9EP97 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Senp3Q9EP97 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Senp3Q9EP97 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Senp3Q9EP97 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Senp3Q9EP97 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Senp3Q9EP97 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Senp3Q9EP97 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Senp3Q9EP97 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Senp3Q9EP97 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Senp3Q9EP97 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Senp3Q9EP97 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Senp3Q9EP97 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Senp3Q9EP97 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Senp3Q9EP97 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Senp3Q9EP97 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Senp3Q9EP97 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Senp3Q9EP97 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Senp3Q9EP97 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Senp3Q9EP97 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Senp3Q9EP97 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms