Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc38a3Q9DCP2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc38a3Q9DCP2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc38a3Q9DCP2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc38a3Q9DCP2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc38a3Q9DCP2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc38a3Q9DCP2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc38a3Q9DCP2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc38a3Q9DCP2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc38a3Q9DCP2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc38a3Q9DCP2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc38a3Q9DCP2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc38a3Q9DCP2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms