Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Med29Q9DB91 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms