Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fundc1Q9DB70 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms