Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB54

Fam216a, Protein FAM216A, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam216aQ9DB54 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam216aQ9DB54 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Fam216aQ9DB54 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Fam216aQ9DB54 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Fam216aQ9DB54 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam216aQ9DB54 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam216aQ9DB54 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam216aQ9DB54 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam216aQ9DB54 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam216aQ9DB54 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam216aQ9DB54 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam216aQ9DB54 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam216aQ9DB54 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam216aQ9DB54 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam216aQ9DB54 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam216aQ9DB54 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam216aQ9DB54 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam216aQ9DB54 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam216aQ9DB54 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam216aQ9DB54 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam216aQ9DB54 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam216aQ9DB54 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam216aQ9DB54 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam216aQ9DB54 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam216aQ9DB54 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam216aQ9DB54 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam216aQ9DB54 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam216aQ9DB54 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam216aQ9DB54 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam216aQ9DB54 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam216aQ9DB54 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam216aQ9DB54 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms