Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf580Q9DB38 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf580Q9DB38 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf580Q9DB38 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf580Q9DB38 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf580Q9DB38 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf580Q9DB38 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf580Q9DB38 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf580Q9DB38 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf580Q9DB38 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf580Q9DB38 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf580Q9DB38 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Znf580Q9DB38 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Znf580Q9DB38 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Znf580Q9DB38 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Znf580Q9DB38 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Znf580Q9DB38 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Znf580Q9DB38 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Znf580Q9DB38 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Znf580Q9DB38 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Znf580Q9DB38 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Znf580Q9DB38 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Znf580Q9DB38 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf580Q9DB38 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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