Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrmuQ9DAT5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms