Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Asf1bQ9DAP7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms