Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldnd2Q9D9H2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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