Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg7Q9D906 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg7Q9D906 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg7Q9D906 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg7Q9D906 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg7Q9D906 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg7Q9D906 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg7Q9D906 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg7Q9D906 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg7Q9D906 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg7Q9D906 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg7Q9D906 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg7Q9D906 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg7Q9D906 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg7Q9D906 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg7Q9D906 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg7Q9D906 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg7Q9D906 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg7Q9D906 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg7Q9D906 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms