Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9D8Q6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms