Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Derl3Q9D8K3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms