Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc52a2Q9D8F3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc52a2Q9D8F3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms