Protein–RNA interactions for Protein: Q9D869

Chp2, Calcineurin B homologous protein 2, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp2Q9D869 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chp2Q9D869 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chp2Q9D869 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chp2Q9D869 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chp2Q9D869 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chp2Q9D869 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chp2Q9D869 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chp2Q9D869 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chp2Q9D869 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chp2Q9D869 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chp2Q9D869 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chp2Q9D869 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chp2Q9D869 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chp2Q9D869 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chp2Q9D869 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chp2Q9D869 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chp2Q9D869 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chp2Q9D869 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chp2Q9D869 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chp2Q9D869 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chp2Q9D869 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chp2Q9D869 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chp2Q9D869 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chp2Q9D869 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chp2Q9D869 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chp2Q9D869 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chp2Q9D869 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
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Chp2Q9D869 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chp2Q9D869 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms