Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms