Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I9

Tgm5, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm5Q9D7I9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tgm5Q9D7I9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tgm5Q9D7I9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tgm5Q9D7I9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tgm5Q9D7I9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tgm5Q9D7I9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tgm5Q9D7I9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tgm5Q9D7I9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tgm5Q9D7I9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tgm5Q9D7I9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tgm5Q9D7I9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tgm5Q9D7I9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tgm5Q9D7I9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tgm5Q9D7I9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tgm5Q9D7I9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tgm5Q9D7I9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgm5Q9D7I9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgm5Q9D7I9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgm5Q9D7I9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgm5Q9D7I9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgm5Q9D7I9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgm5Q9D7I9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgm5Q9D7I9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgm5Q9D7I9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgm5Q9D7I9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgm5Q9D7I9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgm5Q9D7I9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgm5Q9D7I9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgm5Q9D7I9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgm5Q9D7I9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgm5Q9D7I9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tgm5Q9D7I9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms