Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp4cQ9D7F7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4cQ9D7F7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4cQ9D7F7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4cQ9D7F7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4cQ9D7F7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4cQ9D7F7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4cQ9D7F7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4cQ9D7F7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4cQ9D7F7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4cQ9D7F7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4cQ9D7F7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4cQ9D7F7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp4cQ9D7F7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms