Protein–RNA interactions for Protein: Q9D701

Upk3bl1, Uroplakin-3b-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3bl1Q9D701 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3bl1Q9D701 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms