Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nop56Q9D6Z1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nop56Q9D6Z1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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