Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra4Q9D6F4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra4Q9D6F4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms