Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W6

Slco6d1, MCG6225, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco6d1Q9D5W6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slco6d1Q9D5W6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Slco6d1Q9D5W6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slco6d1Q9D5W6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slco6d1Q9D5W6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slco6d1Q9D5W6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slco6d1Q9D5W6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slco6d1Q9D5W6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slco6d1Q9D5W6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slco6d1Q9D5W6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slco6d1Q9D5W6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slco6d1Q9D5W6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slco6d1Q9D5W6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slco6d1Q9D5W6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slco6d1Q9D5W6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slco6d1Q9D5W6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slco6d1Q9D5W6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms