Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcc1Q9D4H2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gcc1Q9D4H2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms