Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubgcp4Q9D4F8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms