Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sohlh2Q9D489 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sohlh2Q9D489 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms