Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D454 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D454 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D454 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D454 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D454 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D454 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D454 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D454 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D454 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D454 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D454 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D454 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D454 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D454 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D454 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D454 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D454 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D454 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D454 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D454 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D454 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D454 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D454 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D454 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D454 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D454 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D454 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D454 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D454 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D454 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D454 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D454 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D454 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D454 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D454 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D454 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D454 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D454 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D454 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D454 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D454 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D454 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D454 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D454 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D454 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D454 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D454 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D454 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D454 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D454 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D454 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D454 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D454 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D454 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D454 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D454 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D454 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D454 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D454 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D454 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D454 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D454 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D454 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D454 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D454 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D454 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D454 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D454 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D454 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D454 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D454 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D454 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D454 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D454 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D454 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D454 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D454 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D454 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D454 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D454 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D454 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D454 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D454 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D454 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D454 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D454 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D454 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D454 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D454 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D454 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D454 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D454 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D454 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D454 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D454 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D454 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D454 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D454 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D454 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.2 ms