Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms