Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms