Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pus10Q9D3U0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus10Q9D3U0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms