Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3N5

5430402E10Rik, RIKEN cDNA 5430402E10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430402E10RikQ9D3N5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5430402E10RikQ9D3N5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430402E10RikQ9D3N5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms