Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Z1

Ceacam20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam20Q9D2Z1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ceacam20Q9D2Z1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ceacam20Q9D2Z1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms