Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q9D2Q3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9D2Q3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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