Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1I5

Mcee, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MceeQ9D1I5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MceeQ9D1I5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms