Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmbr1lQ9D1E5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms