Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms