Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift27Q9D0P8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift27Q9D0P8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift27Q9D0P8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift27Q9D0P8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift27Q9D0P8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift27Q9D0P8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift27Q9D0P8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift27Q9D0P8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift27Q9D0P8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift27Q9D0P8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ift27Q9D0P8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ift27Q9D0P8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ift27Q9D0P8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ift27Q9D0P8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ift27Q9D0P8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ift27Q9D0P8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms