Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbed3Q9D0L1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbed3Q9D0L1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms