Protein–RNA interactions for Protein: Q9D032

Ssbp3, Single-stranded DNA-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp3Q9D032 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp3Q9D032 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms