Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc47Q9D024 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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