Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmss1Q9CZT6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms