Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Shisa9Q9CZN4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Shisa9Q9CZN4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms