Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms